生物统计学与数据科学

研究兴趣

蒙特卡罗方法；重采样方法;多层次模型;数值方法;基因组学;生物信息学

Yang Shi博士于2018年加入奥古斯塔大学乔治亚医学院，担任人口健康科学系生物统计学和数据科学助理教授。他在密歇根大学安娜堡分校获得生物统计学博士和硕士学位，在北京大学获得生物科学学士学位。Shi博士的主要研究兴趣是开发用于大规模基因组数据挖掘和分析的统计方法和计算技术。他目前专注于提高基因组数据分析中基于重采样的测试方法的计算效率，以及应用多层次模型研究复杂基因组数据。此外，他在应用统计方法和生物信息学工具解决生物医学和公共卫生领域的科学问题方面有着广泛的兴趣。具体而言，他对神经科学和癌症研究感兴趣，并与研究人员合作进行统计建模和数据分析，研究不同类型神经和神经精神疾病和癌症的遗传和分子机制，基于人群的预防或临床治疗。

教学领域

统计与机器学习概论；中级理论统计学；高通量基因组数据分析。

选定的出版物

• 王史Y, M, W,李J,江Kang H, H(2019)。交叉熵法小p值的准确有效估计：在基因组数据分析中的应用。生物信息学，35(14):2441-2448。
• Cust AE, Badcock C, Smith J, Thomas N, Haydu L, Armstrong B, Law M, Thompson J, Kanetsky P, Begg C, Shi Y, Kricker A, Orlow I, Sharma A, Yoo S, Leong S, Berwick M, Ollila DW, Lo S.（2019）。《英国皮肤病学杂志》，即将出版。2019年9月提前在线发布：https://doi.org/10.1111/bjd.18524。
• 李施王K, Y, z,肖Y,李J,张X,李(2019)。一项真实世界的观察性研究：转移模式区分初次手术对新生IV期乳腺癌的生存益处。中华外科杂志，45(8):1364-1372。
• 施Y和李j .(2018)。用蒙特卡罗模拟方法计算不等量组随机试验的样本量。医学研究统计方法，27 (9):2569-2580
• 丁东，石伟，石勇（2018）。胚胎移植的数值模拟：移植介质的粘度如何影响胚胎的移植。理论生物学与医学建模，15(1):20。
• Orlow I, Shi Y, Kanetsky PA, Thomas NE, Luo Li, Corrales-Guerrero S, Cust AE, saccheetto L, Zanetti R, Rosso S, Armstrong BK, Dwyer T, Venn A, Gallagher RP, Gruber SB, Marrett LD, Anton-Culver H, Busam K, Begg CB， Berwick M和GEM研究小组（2018）。维生素D受体多态性与诊断前后的阳光照射之间的相互作用影响黑色素瘤的生存。色素细胞与黑色素瘤研究，31(2):287-296。
• Cuzick J, Myers O, Lee JH, Shi Y, Gage JC, Hunt WC, Robertson M， Wheeler CM和新墨西哥州HPV Pap登记指导委员会（2017）。细胞学检查显示非典型鳞状细胞意义不确定的妇女的结果，与未进行人乳头瘤病毒检测相比。中华医学会肿瘤学杂志，3(10):1327-1334。
• 石毅，李建辉（2016）。用蒙特卡罗模拟方法计算不等量组随机试验的样本量。医学研究中的统计方法，2016年12月15日在线发表，https://doi.org/10.1177/0962280216682775
• 石毅，金乃彦，姜宏（2015）。rSeqNP：从RNA-Seq数据中检测差异表达和剪接的非参数方法。生物信息学，31(13):2222-2224。
• 吴达杰*，石勇*，Tomlins SA, Alva A, Siddiqui J，曹旭，Pienta KJ，蒋宏，Chinnaiyan AM, Mehra R（2014）。在致死性、转移性、去势抵抗性前列腺癌患者的快速尸检队列中，ERG基因重排和ERG蛋白表达经常不一致。前列腺杂志，74(12):1199-1208。对本文有同等贡献。
• 史勇，姜浩（2013）。rSeqDiff：利用层次似然比检验从RNA-Seq数据中检测差异亚型表达。科学通报，8(11):798 - 798。